Kurikulum pembelajaran di Program Studi Perikanan FTIK UHT didesain mahasiswa bisa lulus 3,5 - 4 tahun, dengan penerapan metode kuliah kelas, praktikum di laboratorium kampus UHT, praktikum lapangan di Unit Pelaksana Teknis (UPT) milik Dinas Kelautan dan Perikanan Propinsi Jawa Timur maupun milik dinas perikanan kabupaten/kota, maupun indusri pengolahan dan perusahaan swata. Selain itu mahasiswa bisa memanfaatkan masa liburan semester yang cukup panjang untuk magang mandiri di perusahaan-perusahaan perikanan yang menjadi mitra kampus. Selain itu kurikulum pembelajaran di Program Studi Perikanan FTIK UHT juga mendukung program Merdeka Belajar Kampus Merdeka (MBKM) yang memberikan kesempatan mahasiswa untuk belajar di luar kampus.
Materi pembelajaran yang mencakup materi-materi dasar dan perikanan secara umum, diantaranya :
Materi pembelajaran yang mencakup materi-materi kuliah bidang perikanan sesuai dengan peminatan adalah :
- Budidaya Perairan
Pakan Alami
Manajemen Pembenihan Ikan
Sistem Teknologi Budidaya Ikan
Manajemen Parasit Ikan
Genetika dan Reproduksi Ikan
- Pemanfaatan Sumberdaya Perikanan
Teknologi Penangkapan Ikan
Kapal Perikanan
Rancang Bangun Alat Tangkap
Pelabuhan Perikanan
Daerah Penangkapan Ikan
- Pengolahan Hasil Perikanan
Pengendalian Mutu
Pengembangan Produk Perikanan
Metode Analisa Pangan
Tata Letak Perencanaan Pabrik
- Sosial Ekonomi Perikanan
Sosial Ekonomi Perikanan
Kewirausahaan
Selain itu, Program Studi S1 Perikanan UHT juga memberikan materi unggulan yang berbeda dengan perguruan tinggi perikanan lain yaitu :
- Mata Kuliah Selam dengan pengajar dari seorang penyelam profesional. Sehingga mahasiswa memperoleh ilmu dan ketrampilan selam juga mendapat sertifikat hingga brevet selam.
- Magang Budidaya Kerang di Jepang
Prodi Perikanan UHT memberikan peluang kepada mahasiswanya untuk mengikuti kursus Bahasa Jepang secara gratis dan bila lolos tes dari perusahaan budidaya kerang Jepang maka mahasiswa dapat mengikuti program magang di Jepang dengan biaya gratis. Apabila mahasiswa ex magang Jepang sudah lulus kuliah S1 dapat melanjutkan kerja di Jepang dengan status bukan mahasiswa magang.